Irgendwo habt ihr wohl was falsch gemacht.
Ladet euch mal sicherheitshalber cms2day und evtl Module neu runter und überspielt die Dateien per FTP nochmal. Damit kann man wenigstens beschädigte Dateien ausschließen.
Oder Löschen und neu hochladen. Aber bitte die Ordner und Dateien, die eigene Dateien und Einstellungen o.ä, enthalten nicht löschen.
Es waren auch schon oft genug beschädigte Dateien oder fehlerhaft hochgeladene Dateien Schuld daran.
Wenn dies ausgeschlossen ist, dann wurde auf jeden Fall beim Update irgendwas falsch gemacht.
Du sagst zwar, das ihr das Update alles richtig gemacht habt. Aber ich erinnere an letztes Jahr. Da habe ich falsch installierte Updates und die Datenbank dazu manuell repariert. Da hieß es auch das alles richtig gemacht wurde.
Also bitte eigene Fehler nicht ausschließen.