Es wäre hilfreich einen Link zu haben wo man sich Dein Problem anschauen kann oO
Ohne was verändert zu haben(Standard Template) habe ich im Frontend nur "Underline" bei Mouseover über einen Link,
siehe
http://dev.akcms.eu/2.news/1/ (Testlink ist ein Link, underline nur bei Mouseover)
Das der TinyMCE im Backend beim verfassen von Beiträgen, die Links mit "Underline" darstellt ist normales Verhalten eines Browsers da keine speziellen Styles definiert sind und sollte auch nicht weiter stören. Im Frontend kannst Du das Verhalten von Links zum einen über die main.css oder über die modul.css beeinflussen sofern notwendig.